Após perder para Yugi, Pegasus liberta as almas de Seto Kaiba, Mokuba e Salomon. Então, Yami Bakura reaparece, mais uma vez, e desafia Pegasus para um combate. Pegasus perde e Yami Bakura rouba dele o olho do milênio. Em seguida, Yugi e seus amigos conseguem olhar o diário de Pegasus, e descobrem mais sobre ele: No passado, Pegasus teve uma esposa chamada Cecília, que ele amava muito, mas ela morreu de uma doença grave pouco depois que os dois se casaram. Pegasus estava usando o olho do milênio e sequestrando as almas das pessoas para tentar fazer um feitiço para trazer Cecília de volta à vida. Logo depois, Yugi encontra Shadi, que possui a Chave do Milênio, outra relíquia milenar. Shadi diz que sente que há um ladrão à solta - o ladrão de que ele fala é Yami Bakura, já que ele roubou o olho do milênio de Pegasus - e pede para Yugi ter cuidado, pois esse ladrão virá atrás de Yugi no futuro.