O menino do ensino médio, Makoto Niwa, transfere-se para uma nova cidade, onde é apresentado à sua tia, Meme Tōwa. Sonhando em morar sozinho em uma casa de estudante, Makoto descobre que a casa também é habitada por uma garota embrulhada em um colchão de futon, que é apresentada como filha de Meme e prima de Makoto, Erio. Depois de se matricular em sua nova escola, Makoto tenta conhecer Erio, que fala principalmente em jargão científico confuso. Ao levá-la para um supermercado, Makoto é capaz de desfazer o colchão, revelando Erio como uma linda garota de cabelo azul, que afirma ser um investigador descendente de alienígenas, e alegando que a Terra está sendo alvo.