Kotarou Azumi e Akane Mizuno tornaram-se estudantes do terceiro ano na escola secundária júnior e são colegas pela primeira vez. Estes dois, juntamente com companheiros de classe, Chinatsu Nishio e Takumi Hira, se relacionam com seus pares através de compreensões e sentimentos mútuos. À medida que seu último ano na escola secundária avança, o grupo supera seus desafios para amadurecer e tomar consciência de mudanças em si mesmo.

A história da série se passa no ano de 2196, quando a Terra está em guerra contra uma raça de invasores alienígenas, os chamados "jupterianos". Após a derrota sofrida na Primeira Batalha de Marte, a Terra necessita de constante proteção em relação aos ataques desses inimigos, que utilizam naves não-tripuladas, tornando sua real aparência um mistério até os episódios finais. O destino do planeta então se encontra nas mãos da Nergal (ou "Industrias Nergal" como é apresentado no anime dublado), um poderoso conglomerado industrial que acaba de construir a última esperança para a salvação da Terra: uma poderosa nave de batalha, a ND-001 Nadesico. O que a Nergal não contava era que a tripulação seria o principal problema da nave.

Um interruptor misterioso apareceu um dia. Ao pressioná-lo, eles foram enviados para um mundo alternativo diferente !! Há também personagens de outros mundos alternativos reunidos ...!?

A história acompanha Leo, o herói responsável por salvar o mundo da invasão do exercito do rei demônio. Após cumprir seu dever, Leo passou a ser temido e excluído pelas outras pessoas, acabando sem trabalho e completamente desamparado. Percebendo que suas habilidades seria melhor aproveitadas em outro lugar, ele decide ir até o reino dos demônios e se juntar ao exercito para reerguê-lo, conseguindo aliados e amizades onde já mais esperaria.

Na história uma garota que iria realizar seu sonho de começar no emprego de bibliotecária acaba morta em um terremoto, soterrada por sua própria coleção de livros.Ela reencarna como filha de um soldado em outro mundo, onde não existem muitos livros. Impossibilitada de ler, ela não desiste de seus sonhos, decidindo ela mesmo criar livros. E então começa sua jornada para se tornar bibliotecária em um novo mundo.

Após o assassinato do pai, três irmãos se mudam com a mãe para uma casa antiga onde descobrem chaves mágicas que revelam poderes e segredos.

Por algum motivo, a guitarra que ele amava tocar e o basquete que ele adorava jogar perderam a graça. Essa era a vida de Ritsuka Uenoyama até encontrar Mafuyu Sato. Ritsuka tinha começado a perder seu amor pela música, mas ao ouvir Mafuyu cantar pela primeira vez, a canção ressoou em seu coração e a distância entre os dois começou a encurtar.

Henrietta era uma menininha como tantas outras, até o dia em que foi deixada para morrer após ter testemunhado o brutal assassinato da sua família. Terrivelmente traumatizada e sem vontade de viver, permaneceu no hospital em coma até que uma corporação decidiu usá-la para um de seus projetos secretos. Após ter-se submetido a um tipo de lavagem cerebral e ter muito de seu corpo substituído por implantes cibernéticos, Henrietta não tem nenhuma recordação de seu passado e começa sua nova vida como uma assassina, trabalhando para um grupo secreto anti-terrorismo.

Vampiros parecem estar vivendo entre os humanos, mas isto ainda é uma dúvida para o governo pois suas aparências são idênticas a nós e não precisam beber sangue. Mas quando eles tem algum desejo ou se irritam, podem se tornar monstros incontroláveis. Acompanhamos Tsukasa, um estudante universitário que foi resgatado do ataque de um vampiro, e Anzai, seu salvador e membro de uma força-tarefa policial sombria o qual se especializaram em crimes relacionados a estes seres.

Armado com um cinto de metal que se transforma em uma espada, o espadachim, Van, está viajando pelo deserto a procura de um misterioso homem com garras nas mãos. Ao longo do caminho ele encontra uma companheira para a sua viagem: Wendy, que está procurando o seu irmão desaparecido. E nessa busca, eles têm que lutar contra muitos bandidos e uma misteriosa mulher. Tudo isso com direito a muitas batalhas com mecha.

Se passa num mundo onde as mulheres lideram a sociedade graças a invenção da Infinite Stratos, uma poderosa arma que só pode ser equipada por elas. Com isso, pouco a pouco as mulheres começaram a ter seu lugar em postos importantes, até que um dia substituíram o papel dos homens. Num mundo assim, surge um único homem capaz de equipar uma IS e então ele entra para um colégio de treinamento onde só existem garotas.

O jovem estudante do ensino médio Yugi Muto derrota o campeão mundial, Seto Kaiba, em um duelo de cartas com a misteriosa ajuda do quebra-cabeça Millenium. Em razão de sua vitória inesperada, Yugi se torna famoso em todo o mundo e passa a participar de outros duelos para salvar os amigos e a família.